位於安平區之安平抽水站機組更新工程於106年11月9日開工，工程更新2部發電機為環保2期(USA EPA Tier2)引擎及2組3 cms 沉水式抽水機組。可降低發電機啟動對週遭環境之影響外，並將總抽水量由14.4cms提升至15.2cms，日後將可提升對安平區舊部落一帶之防洪功能，目前趁非汛期進行2組抽水機之拆裝工程，於明(108)年1月即可完工運轉。
水利局指出，安平抽水站建置於民國71年，主要收集由安北路以西，王城路、安平路850巷、湖內一街、湖內街以東，運河路以北，鹽水溪以南所形成區域之雨水並抽排入安平港。本站原配置沉水式抽水機2.6cms 與1cms各 4台，總抽水量達14.4cms，因平常外水高於內水，全靠抽水機幫助排水，遇豪雨期間本站常需滿載抽水，機組之性能及穩定性更顯重要，經由本次機組更新降低防洪操作風險。
本抽水站機組改善工程經水利局自105年不斷積極爭取下，終於獲得中央同意補助核定總預算4,400萬元辦理本案機組改善工程，本次機組更新工程包含更新2組原2.6cms抽水機為3cms，總抽水量由原來14.4cms提高至15.2cms；另考慮汛期間停電風險，新設發電機室並汰舊更新2組發電機、供電系統配置重新規劃修正。另外，因本站位於安平國家歷史風景區範圍，特別將站體外部全面抿石子美化，融合安平歷史園區及運河週邊景觀。
目前本工程進度已達90%，於12月汛期結束後開始進行舊抽水機拆除及新抽水機組安裝工程，因現地空間狹小，經與承商多次現勘研商，預期將可克服現場有限空間之施工困難，預計於1月下旬如期完工。完工後將可有效提升安平抽水站效能，發揮穩定抽水功能，降低水患威脅。